一方面，我国第三方物流企业在资金短缺和物流资源丰富的背景下，正面临着巨大的挑战与机遇。由于部分投资者资金不足，难以打造全新的财物型物流企业，他们开始积极寻找和探索“非财物型”的物流方法。而另一方面，传统的物流巨头，拥有众多的优势资源如优秀的仓库、先进的运输设备等，但面临物流资源使用率低下的困境。整合现有资源，建立“非财物型”的第三方物流企业成为了迫切的需求。这不仅能够充分利用社会资源，实现资源共享，还能避免机构臃肿的问题。
在物流服务方面，我国企业的需求层次仍处于初级阶段，主要集中在基础常规项目上。生产企业的需求主要集中在干线运输、市内配送和仓储保管上。而商业企业的需求则稍有不同，更侧重于市内配送和库存管理等。这表明企业对高附加值、综合的物流服务需求较少。我国的第三方物流企业在提供服务时，必须充分考虑企业的实际需求，从基础服务开始，逐步扩展延伸服务。一开始便定位在高层次的第三方物流运作上并不现实。
随着电子商务的兴起，第三方物流与电子商务的整合成为了重要的运作方法之一。第三方物流可以通过作为电子商务的组成部分，承担物流作业，实现B2B或B2C中的物流环节；或者通过建立自己的电子商务，为商家与客户之间提供信息交流、交易、追踪的信息渠道。在我国，宝供物流企业集团便是这一整合方法的佼佼者。他们通过建设基于Internet/Intranet的全国物流信息管理系统，实现了电子商务与物流的紧密配合，大大提高了业务运作效率。
归纳物流代理方法也是我国第三方物流企业的一种重要选择。这种方法要求企业不进行大的固定资产投入，低成本运营，将部分或全部物流作业委托给他人处理，而自己则注重销售队伍和管理网络的建设。像联邦速递、佐川急便等世界知名的第三方物流企业以及我国的储运公司、中外运公司等，都在不同程度上探索实践了这种运作方法。
会集物流方法也是第三方物流企业的一种重要战略。这种方法的特点是企业在某个领域提供集成度较低的物流服务。因为不同领域的客户需求千差万别，当企业能力有限时，他们可以采取会集战略，力求在细分市场上做精做强。例如，有些铁路快运公司提供小件货品的快递服务，而有些物流公司则提供大宗货品的长距离运输。这种在特定领域有特色的第三方物流企业运作方法也是值得重点培养和发展的。
我国的第三方物流企业正面临着巨大的机遇与挑战。通过整合现有资源、提供基础服务、与电子商务整合、采取归纳物流代理方法和会集物流战略等手段，这些企业可以在激烈的市场竞争中脱颖而出，为客户提供更优质的服务。