自改革开放以来，我国农业面临千家万户小生产与千变万化大市场的矛盾。作为农业出产主体的农户数量庞大，但平均耕地面积有限，导致农副产品供应市场时显得分散，规范化和商品化程度不高，粮食商品率仅约30%。这种状况不仅影响农民收入增长，也阻碍了农业产业化和现代化的进程。
党和深刻认识到现代化流转系统对农业产业化及现代化的推动作用。针对农产品流转中的问题，2004年的中央一号文件提出了一系列具体政策和措施。其中包括：立法支持农民专业合作组织的建立，提供信息、技术、培训等支持，金融机构协助建立规范化生产基地、改善农产品运销环境等。
随后，2005年和2006年的中央一号文件进一步明确了农业流通领域的改革方向，包括发展现代物流、电子商务等新型业态和流通方式，加强农业信息化建设和农产品质量安全工作等。国家实施的“5520工程”旨在5年内建立500个规范市场，对农产品流通市场产生巨大影响。
上海作为改革开放和外向型经济的前沿，在农业专业物流系统建设方面做出了积极的探索。位于世界航运中心洋山深水港和浦东国际机场之间的“上海名特农产品世界物流与交易基地”，坚持“从流通系统建设入手服务全国农业”的指导方针，旨在建成世界先进、国内一流的农产品流通服务基地。
该基地借鉴发达国家农产品流通的先进经验，整合运用现代信息技术手段和农产品检测、流通加工、保鲜包装及储运技术，构建一个实体与虚拟相结合、高附加值的创新农产品流通商业系统。其目标是提供高效、优质的农产品流通渠道，成为亚太地区农产品流通链上的重要节点。
在我国，农业出产过程包括产前预备、产中管理、产后加工、商业流通和最终消费等环节，这些环节共同构成了农业生产的链状结构，即农业产业链。而农业专业物流则致力于在满足客户需求的前提下，对农业生产资料与产出物及相关服务和信息进行有效的计划、执行和控制，涉及农业生产资料物流和农产品物流两大类别。在农业的生产链条中，初始阶段和物质转换环节的重要性不容忽视，这催生了农业专业物流的四大类型：农业产前物流、农业生产物流、农产品流通物流以及农业废弃物物流。这些物流形式的核心都是农产品的运输和处理。与一般的工业产品或电子产品物流相比，农产品物流有其独特性，对专业和科学的运输方式有着极高的要求，需要专业的团队和设备进行操作。单个农户难以达到这样的标准。发展农业专业物流可以有效减少农产品在运输过程中的损耗，降低农户的风险。
我国农业专业物流的发展还存在诸多挑战。农产品市场的发育不平衡，结构不合理，多数市场还处于初级阶段，管理水平较低，综合服务功能较弱。农产品的组织化程度较低，难以形成规模运营，导致市场秩序混乱。虽然农产品市场发展势头强劲，但规划和布局存在盲目性，缺乏统一协调和管理。农业专业物流的需求不足，企业和农户依然更倾向于传统的自营物流方式。
随着新农村建设的推进，“以人为本”和谐社会的构建，农业作为关乎人类安全和健康的基石产业，其专业物流的发展应被提升到至关重要的地位。农业专业物流的打造和推进能够更好地服务于现代农业、农业产业化和新农村的建设。我们需要认识到，农业专业物流不仅是运输，更是关乎国计民生的关键环节，它的重要性不言而喻。