跨境电商是分属不同关境的交易主体之间的贸易活动，因而在跨境电商经营中，物流成为至关重要的一个环节。物流成本与物流效率关乎跨境服务的用户体验，成为影响跨境电商行业发展的关键性因素之一。
以出口B2C电商为例，由于多为额小频高的订单且讲求运达时效，国内卖家多采用空运的方式，根据承运方不同和套餐差异，已有多种物流服务可供选择。我们整理了出口电商的主要几种物流模式。
（1）邮政包裹。中国邮政属于万国邮联和卡哈拉邮政组织成员，在业务价格上相对国际快递有绝对优势。据不完全统计，中国出口跨境电商70%的包裹都是通过邮政系统投递，其中中国邮政占据50%左右。中国邮政旗下一般适用出口电商的国际物流服务包括大包、小包，其中邮政小包因其时效快、价格低的综合特质而使用最为广泛。除了中国邮政之外，通过货运代理走香港邮政、新加坡邮政等渠道也是国内商家的重要选择。
（2）国际快递。国际快递可以按照承运方分为商业快递以及国际邮政速递。其中，以联邦快递（FedEx）、联合包裹（UPS）、敦豪速递（DHL）、天地快运（TNT）等四大国际快递公司最为知名，而顺丰速运和“四通一达”等国内快递公司的海外布局日臻完善，也正在向国内商家提供物流选择；中国邮政国际EMS、新加坡EMS、USPS（美国邮政）、PARCELFORCE（英国邮政）则是国际邮政速递服务中相对较为广泛的使用对象。
相对邮政小包而言，国际快递包裹运送快、服务优，价格也相对高。一般国内商家只有在客户时效性要求很强的情况下，才使用商业快递来派送商品。目前，为顺应出口B2C快速发展的需求，有国际快递推出特色服务，如中国邮政EMS和阿里巴巴旗下全球速卖通推出的e邮宝（ePacket），针对2千克以下跨境寄送的包裹收取远低于普通EMS的价格，且投递效率保持了既往水准。
（3）专线物流。一般是通过航空包舱的方式将货物批量运输到国外，再进行目的国的派送，能够通过规模效应降低成本。根据目的地不同，专线物流可分为美国专线、欧洲专线、澳洲专线、俄罗斯专线等。专线物流通常为货运代理或物流服务提供商如出口易、燕文物流整合提供。
（4）传统外贸物流+海外仓。为了解决空运成本高昂、配送周期仍相对较长、以及部分进口国市场跨境电商进口税率高于一般进口等问题，在海外设立仓库进行本地配送成为跨境物流的一大重要趋势。海外仓包括头程运输、仓储管理和本地配送三个部分。海外仓的头程是采用传统的外贸物流方式（海运/空运/陆运），目的国抵境后按照正常清关流程进口，大大降低了清关的障碍；在接受了订单后，直接从海外仓库发货配送，缩短了运送时间和转运流程；，海外仓中存有各类商品的存货，也能实现退换货服务。
表不同物流模式对比
图海外仓储模式
跨境物流，必须通过两道关境，因而跨境物流注定离不开清关/通关这一程序。在我国国境这一端，为解决以往出口和进口电商中跨境物流清关繁琐和税收等问题，中国邮政、顺丰等为代表的物流公司正通过结合海关总署提出的新型跨境电商监管模式，与跨境电商试点城市的跨境通关服务平台合作，实现进出口的快速通关。以中国（杭州）跨境贸易电子商务产业园旗下跨境电商通关服务平台跨境一步达为例，其通过海关总署统一部署，通过“定期申报”，利用信息化手段优化园区内海关、国检、国税、外管、电商企业以及物流企业等之间的流程，方便通关、缴退税、结付汇。