近年来,随着基因测序技术在临床实践上的广泛应用,基因测序市场也迎来快速发展期。不久前,希望组在Github上线了三代测序数据高效纠错、组装软件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1,不仅实现了单Contig一条染色体和超大型基因组组装的突破,也解决了现有三代测序数据组装工具运行时间长、资源占用大、组装质量不稳定的瓶颈,推动了基因行业的发展。
目前华为云基因容器已经率先集成了NextDenovo最新版,用户可以直接上传脚本进行数据分析,不仅简化了使用流程,也免除了后续资源、应用维护的烦恼。
据悉,华为云基因容器服务GCS是华为云在Kubernetes封装了一层关于基因测序的抽象,让基因行业可迅速使用以及或部署容器技术,帮助基因行业的用户提升运营效率。
针对基因行业普遍存在的工具碎片化、系统维护困难、开发语言多样等瓶颈,华为云的基因容器解决方案有“快、省、易、捷”的特点,具体来讲:
“快”是指极速测序:GCS支持10万容器规模,可提供高效任务调度能力,减少等待时间,避免任务死锁等,进一步提升测序分析效率;
“省”来自于华为云的高性价比:算力资源按秒、按需计费,可为企业节省运营成本;
“易”在于免运维:基于Severless架构的容器服务,可实现自动化处罚和执行;
“捷”则体现在华为云带来的一站式服务:将业务体现在一套流程内,避免多套系统操作带来的不便。
基于轻量级的容器技术,GCS结合了深度学习算法、大数据,为测序厂商提供了便捷一站式用户体验、秒级可伸缩的高可靠资源和灵活可定制的测序流程,让基因测序数据的计算更快、更省、更轻松。
据了解,除希望组外,国内基因行业Top 15的企业中,采用华为云的服务占了14家。其中,上海其明信息技术有限公司合作在华为云容器CCI支持下,协作作出1万多次基于基因信息的临床决策,完成了25万例基因数据分析和挖掘。数据显示,上海其明将业务部署在华为云CCI上后,不仅实现了K8S和物理资源免运维,成本降低了30%-50%。
华为云与基因行业的跨界,将帮助基因企业解决技术层面的问题,接下来,华为云还将持续加大研发投入,全力聚焦业务创新,致力为基因行业提供更多切实可行的方法,以科技赋能企业发展。
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