在阿里平台，内蒙古被定义为边疆偏远地区一直被网友诟病，因为这不仅仅是一个定义，还意味着更高的物流费用，对此，内蒙古的卖家体会更为深刻。
在呼和浩特市开网店多年，主营牛肉干、奶制品的刘晓娟就表示“北京是全国的物流中枢，呼和浩特市开车到北京只需要五六个小时，离物流中枢这么近，我区怎么就成了偏远地区?就因为这一项，我们就要多支付5~8元的物流费用，如果顾客不满意，寄回来也需要多花钱。开网店本来就本小利薄、以量取胜，现在的物流费用标准会成为制约我们发展的瓶颈。”
而宜齐商城的董事长付长青，头疼的则是人才瓶颈，他曾向记者抱怨说“可能你想不到，我们网站的设计团队在北京，因为在本地根本找不到这方面的人才。”作为内蒙古电子商务行业协会的副会长，付长青对内蒙古的电商发展环境有更高的期待。
今年3月11日，由内蒙古自治区农牧业厅与淘宝网牵头成立，内蒙古盛路元电子商务有限公司承办的淘宝·特色中国内蒙古馆正式上线运营，主营内蒙古绿色农畜产品，这是全国第九个省级馆，得到了内蒙古各地区政府的大力支持。目前，淘宝·特色中国内蒙古馆入住商家千余家，带来总计600余类万余种商品，通过这个渠道，锡林郭勒盟正镶白旗蒙盛肉业的羊肉产品，进入哈尔滨市家乐福的7家卖场。
淘宝·特色中国内蒙古馆馆长贾宇峰告诉记者“供销信息不对称、流通链条长、产品单一附加值低、生鲜果蔬运输腐损率高是当前我区绿色农畜产品输出面临的主要问题。”
贾宇峰分析，目前，全区还没有一个成熟的农产品供销交易平台，面临“买方找不到卖方，卖方找不到买方”的尴尬局面，在国内大型批发集散地，内蒙古绿色农畜产品“哪个是、怎么买”都成了问题。从目前的情况来看，大部分的农畜产品都是以“经纪人-产地批发商-销地批发商-零售商”的模式到达消费者手中，这样“开放式”的流通过程，节点多，监管难，一旦出现食品安全问题也难以追溯。“我们去年在北京新发地农产品市场看到了自称苏尼特羊肉的产品，售价21元1斤，而当年苏尼特羊的产地价格是26元1斤，从价格上就能看出羊肉有问题，但消费者却很容易受到蒙蔽。”贾宇峰说。
贾宇峰认为，从我区绿色农畜产品企业的整体情况来看，传统企业生产线、产品品类、产品形态单一，有的厂家只有一款产品。产业结构和生产企业分散，同行业产品品牌多，生产规模小，企业各自为战，造成品牌化程度低，加之产品的加工率不高，处在原始加工状态，使得企业和产品本身附加值低，市场竞争力弱。，我区米面粮油类商品，具有一定的品质优势，但在单个产品物流配送上要付出相对高的成本。而果蔬、生鲜类产品运输腐损率高，冷链物流不成熟仍是输出的一大瓶颈。
贾宇峰说“内蒙古绿色农畜产品输出，是一个综合性的大问题，仅仅依靠电子商务打开销路是不够的，需要有更加合理的规划。”
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