在交通方面，宝安国际机场国家物流枢纽以机场为核心，多条高速通道和轨道从周边穿越而过，内部干道将形成“三高、三快、八干道”的骨干路网体系。周边汇集立新湖、尖岗山、石岩等多个战略性新兴产业基地。
宝安国际机场提出了构建深圳机场航空城“3+1+1”的产业功能体系，即核心圈层形成航空运输服务、现代物流服务、航空科技文化体验3大核心产业，支撑圈层形成航空城生活服务1大支撑产业，外围圈层形成临空高新产业服务1大延伸产业。
按照规划，宝安国际机场国家物流枢纽以宝安机场为核心，主要由宝安大道、外排渠、珠江导致线和福永河围合，占地面积约为22.8平方公里。主要包括东货运区、南货运区、北货运区以及机场东动车所等四个功能分区。终打造成为空港型国家物流枢纽，为空港及其辐射区域提供快捷、的国内国际航空直运、中转、集散等物流服务和空海、空铁、空公等联运服务。
目前，宝安正计划开展《宝安国际机场国家物流枢纽综合规划》的编制研究工作，并启动一批基础设施项目建设。项目预计2030年全部竣工。届时，宝安国际机场国家物流枢纽将建设成为国际航空枢纽、华南货运门户、亚太主要快件集散中心，兼顾与其他交通方式的联运，助力宝安经济发展和产业升级，推动粤港澳大湾区建设。